MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 23269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021030	TCG	2	6	639395	639400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_021030	AT	3	6	642014	642019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021030	AAT	2	6	642030	642035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021030	A	6	6	642040	642045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_021030	ACCG	2	8	642060	642067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_021030	AT	3	6	642069	642074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_021030	GAT	2	6	642095	642100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_021030	TGG	3	9	642123	642131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021030	CG	3	6	642167	642172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_021030	GTT	2	6	642206	642211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_021030	AGC	2	6	642223	642228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_021030	TTCAAA	2	12	642249	642260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4013	NC_021030	TTTTG	2	10	643680	643689	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_021030	AG	3	6	643720	643725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_021030	CTT	2	6	643751	643756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_021030	GCGG	2	8	643759	643766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4017	NC_021030	AG	3	6	643788	643793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021030	GGC	2	6	644742	644747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_021030	GCC	2	6	644752	644757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_021030	TTG	2	6	645939	645944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021030	AT	3	6	645996	646001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021030	GCC	2	6	649760	649765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_021030	A	8	8	649781	649788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021030	T	6	6	649908	649913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021030	TGG	2	6	649917	649922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021030	AGGG	2	8	649927	649934	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_021030	GGGC	2	8	649939	649946	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_021030	AAT	2	6	654473	654478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_021030	AAT	2	6	654494	654499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021030	A	6	6	654502	654507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021030	A	7	7	654571	654577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021030	TGG	2	6	654660	654665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_021030	GGCC	2	8	654710	654717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_021030	GTG	2	6	654728	654733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021030	CGC	2	6	654755	654760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_021030	ACG	2	6	654774	654779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_021030	GAC	2	6	654795	654800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_021030	GTG	2	6	654849	654854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_021030	CTG	2	6	654876	654881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_021030	ACG	2	6	654929	654934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_021030	CTA	2	6	654953	654958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_021030	GCC	2	6	655017	655022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_021030	ATC	2	6	655029	655034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_021030	GTT	3	9	655037	655045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_021030	TCA	4	12	655066	655077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_021030	GGC	2	6	655091	655096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_021030	TCG	2	6	655122	655127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_021030	TCG	2	6	655165	655170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_021030	CGG	2	6	655205	655210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_021030	GCG	2	6	655240	655245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_021030	CTGG	2	8	655292	655299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4052	NC_021030	TCG	2	6	655306	655311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_021030	CAA	2	6	655343	655348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_021030	GC	3	6	655375	655380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_021030	CGA	2	6	655388	655393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_021030	TCA	2	6	655444	655449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_021030	CGCC	2	8	655469	655476	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4058	NC_021030	CGA	2	6	655516	655521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_021030	TGC	2	6	655525	655530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_021030	GCT	2	6	655571	655576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_021030	CGC	2	6	655577	655582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_021030	CGA	2	6	655667	655672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_021030	TCA	2	6	655711	655716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_021030	CGC	2	6	655724	655729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_021030	GCT	2	6	655763	655768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_021030	CGT	2	6	655808	655813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_021030	GGC	2	6	655814	655819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_021030	CGCGC	2	10	655840	655849	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4069	NC_021030	CGGG	2	8	655853	655860	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4070	NC_021030	GTC	2	6	655890	655895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_021030	GCG	3	9	655896	655904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_021030	CTC	2	6	655908	655913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_021030	CGG	2	6	655931	655936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_021030	CTG	2	6	655947	655952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_021030	CTG	2	6	655965	655970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_021030	CGG	3	9	656053	656061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_021030	CGCT	2	8	656079	656086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_021030	TGG	2	6	656100	656105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_021030	TGC	2	6	656131	656136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_021030	ATA	2	6	656160	656165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_021030	GTTT	2	8	657215	657222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_021030	AATC	2	8	657235	657242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_021030	TTC	2	6	657261	657266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_021030	AGC	2	6	657270	657275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_021030	ACT	2	6	657333	657338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_021030	ATGAAA	2	12	657353	657364	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_021030	TC	3	6	657379	657384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_021030	CTG	2	6	657386	657391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_021030	GCC	2	6	657482	657487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_021030	GTC	3	9	657506	657514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_021030	ACG	2	6	657518	657523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_021030	CGCC	2	8	657580	657587	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4093	NC_021030	CGG	2	6	657631	657636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_021030	GAG	2	6	657665	657670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_021030	GTG	2	6	657689	657694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_021030	AAG	2	6	657716	657721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021030	TCGA	2	8	657785	657792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_021030	GGT	2	6	657826	657831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021030	CTC	2	6	657835	657840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_021030	TCG	2	6	657857	657862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_021030	TCG	2	6	657884	657889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_021030	TGG	2	6	657912	657917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_021030	CG	3	6	658029	658034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_021030	TCA	2	6	658053	658058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_021030	CAG	2	6	658103	658108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_021030	CGAA	2	8	658176	658183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4107	NC_021030	AGC	2	6	658184	658189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_021030	TAT	2	6	658244	658249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021030	GAC	2	6	658270	658275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_021030	GAC	2	6	658279	658284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_021030	GAC	2	6	658298	658303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_021030	AAC	2	6	658331	658336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_021030	ACC	2	6	658337	658342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_021030	AGC	2	6	658355	658360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_021030	ACT	2	6	658392	658397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_021030	CGG	2	6	658441	658446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_021030	GCT	2	6	658468	658473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_021030	CAA	2	6	658513	658518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_021030	CAA	2	6	658525	658530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_021030	CGG	2	6	658531	658536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_021030	ACG	2	6	658572	658577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_021030	AGA	2	6	658644	658649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_021030	CAT	2	6	658669	658674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_021030	CCTG	2	8	658707	658714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_021030	GAA	2	6	658774	658779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_021030	ACG	2	6	658803	658808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_021030	TCGA	2	8	658817	658824	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4128	NC_021030	GAC	2	6	658835	658840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_021030	TCG	2	6	658946	658951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_021030	GCC	2	6	658955	658960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_021030	TCA	2	6	658968	658973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_021030	CGC	2	6	658999	659004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_021030	CTTCAC	2	12	659104	659115	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4134	NC_021030	TTC	2	6	659131	659136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_021030	CAA	3	9	659149	659157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_021030	CTT	2	6	659164	659169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_021030	GAG	2	6	659201	659206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_021030	CCT	2	6	659253	659258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4139	NC_021030	CAC	2	6	659377	659382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4140	NC_021030	ACC	2	6	659444	659449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4141	NC_021030	TTC	2	6	659480	659485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4142	NC_021030	CTG	2	6	659537	659542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4143	NC_021030	TCG	2	6	659564	659569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4162	NC_021030	ACG	2	6	666319	666324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4164	NC_021030	CTG	2	6	666498	666503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4165	NC_021030	CCG	2	6	666552	666557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4166	NC_021030	GCA	2	6	666578	666583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4205	NC_021030	A	6	6	669155	669160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4251	NC_021030	GCT	2	6	670950	670955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4253	NC_021030	CGT	2	6	670974	670979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4254	NC_021030	TAT	2	6	670990	670995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_021030	CGACG	2	10	671007	671016	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4256	NC_021030	GAC	2	6	671017	671022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_021030	TCT	2	6	671042	671047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4258	NC_021030	CAT	2	6	671061	671066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_021030	GGT	2	6	671094	671099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_021030	CTG	2	6	671110	671115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4261	NC_021030	TCA	2	6	671201	671206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_021030	ACG	2	6	671233	671238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4263	NC_021030	CG	4	8	671256	671263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4264	NC_021030	GCC	2	6	671268	671273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4265	NC_021030	CCT	2	6	671289	671294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4266	NC_021030	AGG	2	6	671310	671315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_021030	GCT	2	6	671355	671360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4268	NC_021030	GGC	2	6	671370	671375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4269	NC_021030	GGAA	2	8	671458	671465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_021030	GC	3	6	671467	671472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4271	NC_021030	TCG	2	6	672123	672128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4273	NC_021030	A	6	6	673123	673128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4275	NC_021030	CA	4	8	673155	673162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4276	NC_021030	ACAA	2	8	673175	673182	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4277	NC_021030	TAG	2	6	673259	673264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4298	NC_021030	AGG	2	6	674169	674174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4382	NC_021030	CGGC	2	8	685751	685758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4383	NC_021030	GGC	2	6	685785	685790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4386	NC_021030	GTA	2	6	686008	686013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4390	NC_021030	CTC	2	6	686113	686118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4391	NC_021030	CGCC	2	8	686136	686143	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4392	NC_021030	GCA	2	6	686169	686174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4393	NC_021030	TCG	2	6	686190	686195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4395	NC_021030	CAG	2	6	686320	686325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4397	NC_021030	CCA	2	6	686481	686486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4398	NC_021030	CGC	2	6	686523	686528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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